O método ensinado é Ashtanga Vinyasa Yoga como foi tradicionalmente ensinado em KPJAYI e como é mantido hoje pelo Paramaguru R. Sharath Jois, originalmente de Mysore, India.
Neste sistema de yoga a sua prática é passada de um para um, de professor para aluno, de guru a shisya, a isto chama-se de parampara. Isto cria uma linhagem directa de conhecimento e desta forma o que aprendemos hoje é naturalmente empoderado pelos ensinamentos que nos precedem, que são ancestrais, conectados à natureza e carregados de sabedoria. 

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Para compreender a história deste método, como o conhecemos hoje, podemos retornar até à vida de T.S. Krishnamacharya., no início do século XX. O guru dos gurus do mundo moderno como foram a Indra Devi, B.K.S. Iyengar, A.G. Mohan, T.V.K. Desikachar e - K. Pattabhi Jois, fundador dos ensinamentos do sistema Ashtanga Vinyasa Yoga.​Cedo na sua vida Krishnamacharya aprendeu a base do método de Ashtanga Vinyasa Yoga, que é Vinyasa Krama, que aprendeu através dos ensinamentos do seu guru Ramamohana Brahmachari sobre o Yoga Kurunta, um texto sagrado em que agora se acredita estar desaparecido. Vinyasa Krama é um intenso método prático de purificação e limpeza do corpo através de respiração e movimento entre asanas (posturas), que também leva a uma mente mais clara e disciplinada. Krishnamacharya teria passado 7 anos seguidos vivendo e estudando com o seu guru e a sua família num local remoto na Mt. Kailash, Himalaias, antes de ele voltar para a civilização com a missão de espalhar a verdadeira sabedoria prática do yoga. Nesta altura Krishnamacharya já tinha chegado aos seus 30.​​​